W biologii, aby opisać konkretny organizm, który należy do królestw zwierząt, grzybów lub roślin, opracowano własną nomenklaturę. Odzwierciedla przynależność do jednego gatunku, w zależności od cech morfologii i wyglądu. W przypadku zwierząt stosuje się kryteria odniesienia do gatunku, w zależności od zdolności do wyprodukowania płodnego potomstwa podczas zapłodnienia. Jednak te wzorce dotyczą tylko tych organizmów, podczas gdy drobnoustrojów nie można sklasyfikować w ten sposób.
Koncepcja odkształcenia w mikrobiologii
Ze względu na obecność ogromnej liczby organizmów, które mają właściwości morfologiczne, ale różnią się cechami biochemicznymi i immunologicznymi, nie jest możliwe zastosowanie standardowej nomenklatury do nazewnictwa. W rezultacie wprowadzono taką koncepcję, jak odmiana. Jest to czysta kultura drobnoustrojów, która została wyizolowana i wyizolowana w określonym miejscu o określonej godzinie.
Każdy drobnoustrój należący do jednego szczepu jest podobny do innego takiego przedstawiciela pod względem kryteriów biochemicznych, morfologicznych, immunologicznych i genetycznych. Ale w obrębie tego samego gatunku bakterii takiej analogii nie obserwuje się. Dlatego szczep jest bardziej elastyczną nazwą kultury drobnoustrojów. Ponieważ szybkowymiana materiału genetycznego (mutacja) prowadzi do pojawienia się nowych organizmów w obrębie gatunku, ale o różnych właściwościach, to właśnie ta definicja pozwala nam dokładniej scharakteryzować czynniki patogeniczności i zjadliwości.
Szczepy bakteryjne
Istniejąca nomenklatura bakterii umożliwia klasyfikację typów organizmów, ale nie charakteryzuje ich nowych właściwości. Te ostatnie pojawiają się w wyniku szybkich mutacji, nabierając nowych właściwości, w tym patogennych dla ludzi, zwierząt gospodarskich i roślin oraz innych drobnoustrojów. Przykład nazewnictwa na przykładzie Escherichia coli wygląda następująco: królestwo - bakterie, typ - Proteobacteria, klasa gamma-proteobakterii, rząd - Enterobacteriales, rodzina Enterobacteria. Rodzaj to Escherichia, a gatunek to Escherichia colli. Istnieje jednak wiele kultur bakterii z gatunku Escherichia colli, wykazujących różne właściwości. Są izolowane na osobne szczepy bakterii i mają dodatkową nazwę. Na przykład Escherichia colli O157:H7.
Sama E. coli jest obecna w jelicie człowieka i nie powoduje choroby, ale szczep O157:H7 jest wyłącznie patogenny ze względu na obecność dużej liczby czynników zjadliwości. W ciągu ostatnich 5 lat doświadczyła epidemii chorób enterotoksygennych.
Szczepy wirusów
Koncepcja szczepu to elastyczna nazwa dla organizmów o tych samych właściwościach, które zostały wyizolowane, a następnie zidentyfikowane i opisane w określonym obszarze w określonym czasie. W swoim przebiegu wirus może nabyć nowe właściwości dzięki antygenowościdryf. Stworzy to nowy szczep wirusa, prawdopodobnie bardziej patogenny niż jego rodzic.
Można wyraźnie pokazać pojawianie się nowych szczepów na przykładzie wirusa grypy. Należy do rodziny Orthomyxoviruses i nosi nazwę w zależności od antygenów (hemaglutyniny i neuraminidazy) HxNy. X i Y to wartości liczbowe odzwierciedlające obecność antygenów. Przykładem jest H5N1, znany z niedawnej epidemii świńskiej grypy z szybko postępującym krwotocznym zapaleniem płuc. Zgodnie z teorią, z tego szczepu może rozwinąć się nowy i bardziej niebezpieczny szczep ze względu na ten sam dryf antygenowy.
Szczepy grzybicze i szczepy protistów
Pleśnie są najmniej zmienną ze wszystkich drobnoustrojów, chociaż ich biochemia jest również złożona. Ze względu na bardziej złożoną budowę niż bakterie i wirusy, a także ze względu na brak mechanizmów szybkiego transferu genów, liczba nowych szczepów grzybów nieznacznie wzrasta. Istnieje również opinia, że każdy nowo odkryty szczep grzyba jest wcześniej istniejącym organizmem, który po prostu nie trafił do badaczy.
Podobna sytuacja istnieje w królestwie protistów. Ich zdolność do mutacji jest niska, więc prawdopodobieństwo szybkiego pojawienia się nowych szczepów jest bardzo małe. Jednak wciąż pojawiają się nowe warianty organizmów tego samego gatunku. Dlatego podobno istniały również wcześniej, ale nie zostały odkryte.
