Deoksyryboza to 5-węglowy monosacharyd (pentoza), który powstaje z rybozy, gdy traci jeden atom tlenu. Empiryczny wzór chemiczny dezoksyrybozy to C5H10O4, a ze względu na utratę atom tlenu, nie zgadza się z ogólnym wzorem dla monosacharydów (CH2O) , gdzie n jest liczbą całkowitą.
Właściwości fizyczne i chemiczne
Liniowy wzór dezoksyrybozy można przedstawić w następujący sposób: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Jednak istnieje również w postaci zamkniętego pierścienia atomów węgla.
Deoksyryboza to bezbarwne ciało stałe, bezwonne i dobrze rozpuszczalne w wodzie. Jego masa cząsteczkowa wynosi 134,13 g/mol, temperatura topnienia 91 °C. Pozyskiwany jest z rybozo-5-fosforanu dzięki działaniu odpowiednich enzymów podczas chemicznej reakcji redukcji.
Różnica między rybozą a dezoksyrybozą
Jak już wspomniano i jak sama nazwa wskazuje, dezoksyryboza jest związkiem chemicznym, którego skład atomowy różni się od rybozy tylko jednym atomem tlenu. Jak pokazanona poniższym rysunku dezoksyryboza nie ma grupy hydroksylowej OH na swoim drugim atomie węgla.
Deoksyryboza jest częścią łańcucha DNA (kwasu dezoksyrybonukleinowego), podczas gdy ryboza jest częścią łańcucha RNA (kwasu rybonukleinowego).
Ciekawe, że monosacharydy arabinoza i ryboza są stereoizomerami, to znaczy różnią się rozmieszczeniem przestrzennym względem płaszczyzny pierścienia grupy OH w pobliżu drugiego atomu węgla. Deoksyarabinoza i dezoksyryboza to ten sam związek, ale użyto drugiej nazwy, ponieważ ta cząsteczka pochodzi od rybozy.
Deoksyryboza i informacje genetyczne
Ponieważ deoksyryboza jest częścią łańcucha DNA, odgrywa ważną rolę biologiczną. DNA - źródło informacji genetycznej, składa się z nukleotydów, do których należy dezoksyryboza. Cząsteczki dezoksyrybozy łączą jeden nukleotyd z drugim w łańcuchu DNA poprzez grupy fosforanowe.
Stwierdzono, że brak grupy hydroksylowej OH w dezoksyrybozie nadaje mechaniczną elastyczność całemu łańcuchowi DNA w porównaniu z RNA, co z kolei umożliwia cząsteczce DNA utworzenie podwójnej nici i zwartej formy wewnątrz jądro komórkowe.
Ponadto, ze względu na elastyczność wiązań między nukleotydami utworzonymi przez cząsteczki dezoksyrybozy i grupy fosforanowe, łańcuch DNA jest znacznie dłuższy niż RNA. Fakt ten umożliwia kodowanie informacji genetycznej z dużą gęstością.
