Utworzenie komórki eukariotycznej było drugim najważniejszym (po pojawieniu się życia) wydarzeniem ewolucyjnym. Główną i fundamentalną różnicą między eukariontami a organizmami prokariotycznymi jest obecność bardziej zaawansowanego systemu genomu. Dzięki pojawieniu się i rozwojowi jądra komórkowego znacznie wzrósł stopień przystosowania organizmów jednokomórkowych do regularnie zmieniających się warunków egzystencji oraz zdolność do szybkiej adaptacji bez wprowadzania znaczących zmian dziedzicznych w układzie genowym.
Komórka eukariotyczna, której cytoplazma jest obszarem aktywnych procesów metabolicznych, skutecznie oddzielona od strefy przechowywania, odczytu i reduplikacji informacji genetycznej, okazała się zdolna do dalszej ewolucji biologicznej. To epokowe i brzemienne w skutki wydarzenie ewolucyjne, według naukowców, miało miejsce nie później niż 2,6 miliarda lat temu na styku dwóch geologicznych kamieni milowych - archaiku i proterozoiku.
Wzrost zdolności adaptacyjnych i stabilności struktur biologicznych jest niezbędnym warunkiem pełnej ewolucji biologicznej. To właśnie dzięki swojej wysokiej zdolności adaptacyjnej komórka eukariotyczna była w stanie ewoluować do organizmów wielokomórkowych o złożonej organizacji strukturalnej. Rzeczywiście, w wielokomórkowych układach biologicznych komórki o tym samym genomie, dostosowujące się do zmieniających się warunków, tworzą tkanki, które są zupełnie inne, zarówno pod względem właściwości morfologicznych, jak i funkcjonalności. To wielkie ewolucyjne zwycięstwo eukariontów, które doprowadziło do pojawienia się tak wielkiej różnorodności form życia na planecie i wejścia na ewolucyjną arenę samego człowieka.
Struktura komórek typu eukariotycznego ma kilka charakterystycznych cech, które nie są charakterystyczne dla prokariotów. Komórka eukariotyczna zawiera dużą ilość materiału genetycznego (90%), który jest skoncentrowany w strukturach chromosomowych, co zapewnia ich różnicowanie i specjalizację. Każda komórka eukariotyczna charakteryzuje się obecnością oddzielnego jądra. Jest to główna cecha wyróżniająca ten typ komórek. Inną ważną różnicą w stosunku do prokariotów są organelle komórki eukariotycznej - stałe i zróżnicowane struktury wewnątrzkomórkowe.
Komórka eukariotyczna, w porównaniu z komórką prokariotyczną, ma bardziej złożony, wieloetapowy system percepcji różnych substancji. W naturze nie ma typowej uniwersalnej komórki typu eukariotycznego. Wszyscycharakteryzuje się niesamowitą różnorodnością, która wynika właśnie z potrzeby adaptacji ewolucyjnej. Bardzo ważną cechą eukariontów jest ich nieodłączna kompartmentalizacja - lokalizacja wszystkich procesów biochemicznych w oddzielnych przedziałach komórkowych oddzielonych błoną wewnątrzkomórkową. Eukarionty mają wiele złożonych elementów strukturalnych. Takich jak system membranowy; matryca cytoplazmatyczna, która jest główną substancją wewnątrzkomórkową; organelle komórkowe są głównymi funkcjonalnymi składnikami eukariontów.
